營利事業因被投資公司營運虧損，導致產生損失時，財政部南區國稅局表示，在稅務處理上，營利事業列報投資損失應以實現者為限，亦即被投資事業營運發生虧損，以致原出資額實際發生折減，才可列報投資損失；而計算投資損失時，必須特別注意以前年度已列報投資損失者，應於原出資額中先予扣除。
該局說明，依營利事業所得稅查核準則第99條規定，營利事業列報投資損失，應有被投資事業之減資彌補虧損、合併、破產或清算等證明文件，但是被投資事業在國外且無實質營運活動者，應以其轉投資具有實質營運之事業，因營業上虧損致該國外被投資事業發生損失之證明文件，並應有我國駐外使領館、商務代表或外貿機關之驗證或證明；在大陸地區者，應有大陸委員會委託處理臺灣地區與大陸地區人民往來有關事務之機構或團體之證明。
該局進一步說明，營利事業計算投資損失時，尚須注意該筆投資成本是否曾已列報損失，以免重複列報。該局舉例，甲公司於95年間投資乙公司，投資成本為3千5百萬元，乙公司於100年度辦理減資彌補虧損，甲公司於辦理100年度結算申報依投資成本按減資比例60%列報投資損失2千1百萬元，嗣乙公司持續虧損，遂於109年辦理清算結束營業，甲公司取得乙公司清算分配款5百萬元，故甲公司於109年度營利事業所得稅結算申報可列報之投資損失應為9百萬元(3,500萬元-2,100萬元－500萬元)。
該局提醒，營利事業列報投資損失時，除需注意以實現者為限及應檢附被投資事業減資彌補虧損或合併、破產、清算之相關證明文件外，且要注意需扣除以前年度已申報之投資損失，以免損失重複列報而遭補稅處罰，影響自身權益。